La Filarmonica di San Gennaro fu costituita il 13 marzo 1894. Il primo servizio ufficiale fu la partecipazione alla tradizionale processione del Venerdì Santo del 1895 ma già nel 1897 la troviamo ad esibirsi a Lucca e a Pisa. Un avvenimento tra i più significativi nella sua storia è sicuramente la nomina a socio onorario del noto maestro lucchese Gaetano Luporini, avvenuta nel 1896. A Luporini poi, nel 1908, fu intitolata la Filarmonica. Nata per diffondere soprattutto tra i giovani la cultura musicale, negli anni si è aperta a nuove esperienze come la collaborazione di cori e cantanti solisti con il conseguente ampliamento del repertorio. Da ricordare alcuni concerti, come quello del settembre 2001 in occasione del centenario della morte di Giuseppe Verdi, in cui furono eseguiti alcuni tra i cori più conosciuti del grande musicista. Nel luglio 2004 è stata coinvolta nella realizzazione in una versione per banda, coro e strumenti solisti, della Buona Novella, il disco che Fabrizio De Andrè ha prodotto negli anni settanta, con la voce solista di David Riondino. Un’altra grande esperienza che rimarrà memorabile nella storia della Filarmonica è stata l’esecuzione del concerto eseguito il 26 ottobre 2004 nella Basilica Superiore di San Francesco in Assisi. Altro significativo evento è stato il concerto tenuto in Villa Reale a Marlia nel 2008 in occasione dei festeggiamenti per i 150 anni della nascita di Giacomo Puccini. Nel 2009 la Filarmonica si è cimentata nell’esecuzione della Messa a quattro voci per soli, coro e orchestra di Giacomo Puccini (strumentazione Giampaolo Lazzeri) effettuata più volte unitamente alla corale Santa Felicita di Ponte a Moriano, al coro Città di Pistoia e al coro Giacomo Puccini di Grosseto. Nel dicembre 2009 è stata la volta del Concerto di Natale al Teatro del Giglio di Lucca che l’ha vista esibirsi con due cori gospel, St. Jacob’s Choir e Vijay & Joyful Angels, con la partecipazione straordinaria di Cheryl Porter. Nel 2010, sempre per il Concerto di Natale, la Filarmonica si è esibita con la star internazionale Amii Stewart. Nel 2011 grande apprezzamento da parte del pubblico ha avuto il concerto del 25 aprile, nell’Auditorium di San Romano, in occasione dei 150 anni dell’Unità d’Italia. È stata poi la volta del concerto nella Chiesa di Santa Maria dei Servi a Lucca realizzato il 4 maggio. La Filarmonica, insieme alla Corale Madonna di Coro di San Gennaro, alla Corale della Collegiata di Montecarlo, alla Corale St. Jacob’s Choir di Montecalvoli e alla Corale San Giusto di Porcari, ha proposto una selezione di brani del noto compositore di canti liturgici mons. Marco Frisina e presentati dallo stesso compositore invitato per l’occasione. Il 31 marzo 2012, a Roma, la Filarmonica, insieme al Coro della Diocesi di Roma, ha tenuto un concerto di musica sacra nella Basilica di Santa Maria degli Angeli e dei Martiri con la direzione di mons. Frisina e del M° Lazzeri. Il 16 dicembre 2012 si è esibita al Teatro del Giglio di Lucca insieme alla cantante Antonella Ruggiero mentre il 14 settembre 2013, nella splendida cornice della Chiesa di San Francesco in Lucca appena restaurata ha tenuto La Divina Commedia in Concerto di Mons. Marco Frisina, concerto che è stato ripetuto il 28 settembre a Roma nella Basilica di San Giovanni in Laterano di fronte a 2000 persone. La Gaetano Luporini ha inoltre eseguito, sempre in San Francesco, due eventi musicali di alto livello: il 15 dicembre il tradizionale Concerto di Natale con la cantante Kimberly Ann Convington e i suoi vocalist e il 16 aprile 2014 il Concerto di Pasqua Le Sette Parole dell’Agonia di Nostro Signore Gesù Cristo con il Coro San Francesco e Santa Chiara a Montughi e il Coro Città di Pistoia con i tenori Enrico Nenci, Simone Maresca e i bassi Enrico Rotoli, Marcello Vargetti. Altri successi della «Gaetano Luporini» sono stati: l’8 dicembre 2014 il Concerto di Natale in San Francesco con la partecipazione di Neja; il 1° aprile 2015, sempre nella Chiesa di San Francesco il Concerto di Pasqua, il 2 agosto 2015 sul piazzale della Pieve di San Gennaro la rappresentazione della Cavalleria rusticana, opera in atto unico di Pietro Mascagni tratta dall’omonima novella di Giovanni Verga, ed il concerto di Natale 2015 con la partecipazione di Ivana Spagna. Il concerto di Natale 2016 ha visto come ospite la cantante Mariella Nava ed il Coro delle mani bianche della scuola popolare di musica di Testaccio di Roma.
Un evento particolarmente significativo è stata la realizzazione de La Passione di Cristo secondo Marco di Lorenzo Perosi eseguita in San Francesco il 23 marzo 2016 con la partecipazione della Cappella musicale della Cattedrale di San Miniato e la corale “San Genesio” della Diocesi di San Miniato (PI), diretti dal maestro Carlo Fermalvento, oltre ai solisti Matteo Michi, Antonio Menicucci, Massimo Naccarato e Paolo Porfiri. La Passione è stata strumentata per orchestra di fiati dal maestro Giampaolo Lazzeri ed ha avuto positivi riscontri, a livello nazionale, tra i massimi studiosi del maestro di Tortona. Incoraggiata dall’originalità della proposta e dal successo ottenuto la Filarmonica ha deciso di proporre, nel concerto di Pasqua del 5 aprile 2017, ancora un oratorio di Lorenzo Perosi, il Transitus Animae, anch’esso strumentato dal M° Lazzeri. Il concerto ha attirato nella chiesa di San Francesco diversi studiosi tra i quali il M° Arturo Sacchetti, massimo esperto e divulgatore della musica di Perosi, che ha tenuto una prolusione intorno alla figura del musicista. Un’altra importante iniziativa è stata l’esecuzione, il 28/3/2018 nella Chiesa di San Francesco, dei Quattro pezzi sacri di Giuseppe Verdi e del mottettone per la Santa Croce del 2008 del M° don Emilio Citti sempre strumentati da Giampaolo Lazzeri.
Il maestro Lazzeri è Direttore della Filarmonica dall’anno 2000.
Romano Citti, dopo trentaquattro anni di presidenza della Filarmonica (1982 – 2016), alla scadenza naturale degli organi dell’associazione (novembre 2016), ha deciso di lasciare l’incarico. Il nuovo Consiglio direttivo ha eletto Presidente Fabrizio Michelini.